Pseudo-prolindipeptider indeholder oxazoler dannet af serin eller threonin. Når de behandles med trifluoreddikesyre (TFA), omdannes oxazolerne til serin eller threonin. Oxazolerne har strukturel lighed med prolin og kaldes således pseudo-prolin. Ligesom prolin danner pseudo-prolin en "kink" i peptidets polyamid rygrad. Denne kink forstyrrer de interchain -hydrogenbindinger, der er ansvarlige for aggregering. Inkorporering af pseudo-prolin i peptidsekvensen forbedrer koblingseffektiviteten og forbedrer derved peptidets renhed og udbytte. Kobling til pseudo-prolin er vanskelig, og koblingsudbyttet er normalt lavt. Derfor anvendes pseudo-prolin som et præformet pseudo-prolindipeptid i peptidsyntese.
Pseudoprolin er stabil under svagt sure forhold. Peptider indeholdende pseudoprolin kan fremstilles på 2-chlorotrityylharpiks eller sieberharpiks og spaltes i nærvær af pseudoprolin.
Sammenlignet med de tilsvarende standardpeptider har peptider indeholdende pseudo-prolin bedre opløselighed. Dette gør peptider, der indeholder pseudo-prolin lettere at rense og bruge i fragmentkondensationsreaktioner. Derudover kan peptider med pseudo-prolin ved C-terminalen kobles uden racemisering af den C-terminale rest.
Knuden forårsaget af pseudo-prolin i lineære peptider hjælper med at danne cykliske peptider. Det er rapporteret, at tilsætningen af pseudo-prolin kan øge udbyttet af cykliske peptider og fremskynde cykliseringsreaktionen.
Pseudo-prolin forstyrrer hydrogenbindinger i peptidets rygrad.
Pseudo-prolin forstyrrer hydrogenbindinger mellem peptidkæder.
Pseudo-prolin blokerer dannelsen af asparagin-biprodukter og dem, der er produceret ved dannelsen af asparagin. Det bruges i semisyntesen af R2-underenheden af Escherichia coli ribonucleotidreduktase. Denne metode er også for nylig blevet anvendt til syntesen af glycopeptid -domænet af erythropoietin.
Retningslinjer for anvendelse af pseudoprolindipeptid
Hvis det er muligt, skal du indsætte en pseudo-prolin inden den hydrofobe region.
Der skal være mindst to aminosyrer mellem pseudo-prolinrester eller mellem pseudo-prolin og prolin.
Den optimale afstand er 5 til 6 aminosyrer mellem pseudo-proliner eller mellem en pseudo-prolin og en prolin.
Posttid: 2025-08-13