Typer af peptidbiblioteker

Alanine scanningsbibliotek
    Ala-scanningspeptidbiblioteket er en metode til at identificere virkningerne af specifikke aminosyrer i en sekvens på peptidfunktionen. Vi erstatter sekventielt aminosyrerne i sekvensen med Ala; gennem Ala-scanningspeptidbiblioteket kan virkningen af ​​specifikke aminosyrer på den overordnede proteinstruktur, funktion og andre biologiske aktiviteter identificeres.

Positional Scanning Library (PSL)
    Et positionelt scanningspeptidbibliotek er et vigtigt værktøj til optimering af peptidsekvenser. Den erstatter systematisk andre aminosyrer med udvalgte regioner eller steder i et peptid og bestemmer de optimale aminosyrer på disse steder gennem peptidaktivitetsassays. Denne type peptidbibliotek hjælper forskere med at identificere specifikke regioner, der har særlige virkninger eller aktiviteter på specifikke positioner.

Overlappende bibliotek

Det overlappende peptidbibliotek er en almindelig metode til screening af lineære eller kontinuerte epitoper. Designet af peptidbiblioteket er hovedsageligt bestemt af to parametre: peptidlængde og offsetnummer. Da proteinet er trunkeret fra N-terminalen til C-terminalen, er det muligt, at et forældreløst peptid kan være tilbage i enden. For at opretholde ensartet længde anbefaler vi at skifte en eller flere aminosyrer fra N-terminalen.

Trunkeringspeptidbiblioteker

Trunkeringspeptidbiblioteker bruges til at identificere de korteste aminosyresekvenser i en peptidsekvens. Konstruktionen af ​​trunkeringspeptidbiblioteker involverer typisk systematisk fjernelse af aminosyrer fra begge ender af den oprindelige peptidsekvens. Hvis visse vigtige aminosyrer er kendt, bør disse aminosyrer bevares, og aminosyrer fjernes derefter én efter én fra den anden ende af peptidet for at begynde screeningen.

Tilfældigt peptidbibliotek

Tilfældige peptidbiblioteker er designet via en shotgun-tilgang til at inkludere de 20 naturlige aminosyrer, mens de samtidig tilfældigt substituerer udvalgte aminosyrerester.

Scrambled Bibliotek

Designet af kodede biblioteker er baseret på interne omlejringer af den oprindelige peptidaminosyresekvens. Det er peptidbiblioteket med den højeste grad af mutation. Forstyrrede peptider bruges ofte som negative kontroller for at demonstrere, at specifikke sekvenser er kritiske for proteinfunktion eller aktivitet. Det er også et tilfældigt screeningsværktøj, der bruges til at identificere nye mål.