Hvad er cellepenetrerende peptider?

Cellepenetrerende peptider er små peptider, der let kan trænge ind i cellemembranen. Denne klasse af molekyler, især CPP'er med målretning af funktioner, giver løfte om effektiv lægemiddelafgivelse til målceller.

Derfor har forskningen på den bestemt biomedicinsk betydning. I denne undersøgelse blev CPP'er med forskellige transmembraneaktiviteter undersøgt på sekvensniveauet, forsøgte at finde ud af de faktorer, der påvirker transmembraneaktiviteten af ​​CPP'er, sekvensforskellene mellem CPP'er med forskellige aktiviteter og ikke -CPP'er og indfører en metode til analyse af biologiske sekvenser.

CPPS- og ikke -CPPS -sekvenser blev opnået fra CPPSite -databasen og forskellige litteraturer, og transmembrane peptider (HCPPS, MCPPS, LCPP'er) med høje, mellemstore og lav transmembrane aktivitet blev ekstraheret fra CPPS -sekvenserne til konstruktionsdatasæt. Baseret på disse datasæt blev følgende undersøgelser udført:

1, blev aminosyren og den sekundære struktursammensætning af forskellige aktive CPP'er og ikke -CPP'er analyseret af ANOVA. Det blev konstateret, at de elektrostatiske og hydrofobe interaktioner mellem aminosyrer spillede en vigtig rolle i transmembraneaktiviteten af ​​CPP'er, og den spiralformede struktur og tilfældige spiralede påvirkede også transmembraneaktiviteten af ​​CPP'er.

2.. De fysiske og kemiske egenskaber og længder af CPP'er med forskellige aktiviteter blev vist på det to-dimensionelle plan. Det blev fundet, at CPP'er og ikke -CPP'er med forskellige aktiviteter kunne samles under nogle specielle egenskaber, og HCPP'er, MCPP'er, LCPP'er og ikke -CPP'er blev opdelt i tre klynger, der viste deres forskelle;

3. i dette papir introduceres begrebet fysisk og kemisk centroid af biologisk sekvens, og de rester, der komponerer sekvensen, betragtes som partikelpunkter, og sekvensen abstraheres som et partikelsystem til forskning. Denne metode blev anvendt til analysen af ​​CPP'er ved at projicere CPP'er med forskellige aktiviteter på 3D -planet ved PCA -metoden, og det blev fundet, at de fleste CPP'er samlet sammen og nogle LCPP'er samlet sammen med ikke -CPP'er.

Denne undersøgelse har konsekvenser for design af CPP'er og forståelse af forskellene i sekvenserne af CPP'er med forskellige aktiviteter. Derudover kan analysemetoden til fysisk og kemisk centroid af biologiske sekvenser, der er introduceret i dette papir, også bruges til analyse af andre biologiske problemer. På samme tid kan de bruges som inputparametre til nogle biologiske klassificeringsproblemer og spille en rolle i mønstergenkendelse.