Designskema og opløsning af polypeptidpeptidkæde

I. Resumé
Peptider er specielle makromolekyler, således at deres sekvenser er usædvanlige i deres kemiske og fysiske egenskaber.Nogle peptider er svære at syntetisere, mens andre er relativt nemme at syntetisere, men svære at rense.Det praktiske problem er, at de fleste peptider er svagt opløselige i vandige opløsninger, så i vores oprensning skal den tilsvarende del af det hydrofobe peptid opløses i ikke-vandige opløsningsmidler. Derfor er disse opløsningsmidler eller buffere sandsynligvis stærkt inkonsistente med brugen. af biologiske eksperimentelle procedurer, således at teknikere er strengt forbudt at bruge peptidet til deres egne formål, således at det følgende er flere aspekter af design af peptider til forskere.

Designskema og opløsning af polypeptidpeptidkæde
For det andet det korrekte valg af syntetiske vanskelige peptider
1. Samlet længde af nedregulerede sekvenser
Peptider på mindre end 15 rester er lettere at opnå, fordi størrelsen af ​​peptidet øges, og renheden af ​​råproduktet falder.Da den samlede længde af peptidkæden stiger ud over 20 rester, er den præcise produktmængde et centralt problem.I mange eksperimenter er det let at få uventede effekter ved at sænke resttallet til under 20.
2. Reducer antallet af hydrofobe rester
Peptider med en stor overvægt af hydrofobe rester, især i området 7-12 rester fra C-terminalen, forårsager sædvanligvis syntetiske vanskeligheder.Dette ses som en utilstrækkelig kombination, netop fordi der opnås et B-foldet ark i syntesen."I sådanne tilfælde kan det være nyttigt at konvertere mere end to positive og negative rester eller at sætte Gly eller Pro i peptidet for at låse op for peptidsammensætningen."
3. Nedregulering af "svære" rester
"Der er en række Cys-, Met-, Arg- og Try-rester, der generelt ikke er let syntetiserede."Ser vil typisk blive brugt som et ikke-oxidativt alternativ til Cys.
Designskema og opløsning af polypeptidpeptidkæde

For det tredje, forbedre det korrekte valg af opløseligt i vand
1. Juster N- eller C-terminalen
I forhold til sure peptider (dvs. negativt ladede ved pH 7), anbefales acetylering (N-terminal acetylering, C-terminal altid opretholder en fri carboxylgruppe) for at øge den negative ladning.Men for basiske peptider (det vil sige positivt ladede ved pH 7) anbefales aminering (fri aminogruppe ved N-terminalen og aminering ved C-terminalen) især for at øge den positive ladning.

2. Forkort eller forlænge sekvensen kraftigt

Nogle af sekvenserne indeholder et stort antal hydrofobe aminosyrer, såsom Trp, Phe, Val, Ile, Leu, Met, Tyr og Ala osv. Når disse hydrofobe rester overstiger 50%, er de normalt ikke nemme at opløse.Det kan være nyttigt at forlænge sekvensen for yderligere at øge de positive og negative poler af peptidet.Den anden mulighed er at nedregulere størrelsen af ​​peptidkæden for at øge de positive og negative poler ved at nedregulere de hydrofobe rester.Jo stærkere de positive og negative sider af peptidkæden er, jo større er sandsynligheden for, at den reagerer med vand.
3. Læg en vandopløselig rest i
For nogle peptidkæder kan kombinationen af ​​nogle positive og negative aminosyrer forbedre vandopløseligheden.Vores firma anbefaler at N-terminalen eller C-terminalen af ​​sure peptider kombineres med Glu-Glu.N- eller C-terminalen af ​​det basiske peptid blev givet og derefter Lys-Lys.Hvis den ladede gruppe ikke kan placeres, kan Ser-Gly-Ser også placeres i N- eller C-terminalen.Denne tilgang virker dog ikke, når siderne af peptidkæden ikke kan ændres.