I dette papir introduceres to grundlæggende aminosyrer, glycin (Gly) og alanin (Ala).Dette skyldes hovedsageligt, at de kan fungere som base aminosyrer, og at tilføje grupper til dem kan generere andre slags aminosyrer.
Glycin har en særlig sød smag, så dens engelske navn kommer fra det græske glykys(sød).Den kinesiske oversættelse af glycin har ikke kun betydningen af "sød", men har også den lignende udtale, som kan kaldes modellen for "trofasthed, præstation og elegance".På grund af sin søde smag bruges glycin ofte som et smagsstof i fødevareindustrien for at fjerne bitterhed og øge sødmen.Sidekæden af glycin er lille med kun et brintatom.Det gør ham anderledes.Det er en basisk aminosyre uden chiralitet.
Glycin i proteiner er kendetegnet ved sin lille størrelse og fleksibilitet.For eksempel er den trestrengede helix-konformation af kollagen meget speciel.Der skal være én glycin for hver to rester, ellers vil det forårsage for meget sterisk hindring.Tilsvarende kræver koblingen mellem to domæner af et protein ofte glycin for at give konformationel fleksibilitet.Men hvis glycin er fleksibel nok, er dets stabilitet nødvendigvis utilstrækkelig.
Glycin er en af spoilere under α-helix dannelse.Årsagen er, at sidekæderne er for små til overhovedet at stabilisere konformationen.Derudover bruges glycin ofte til at fremstille bufferopløsninger.De af jer, der laver elektroforese, husker det ofte.
Det engelske navn på alanin kommer fra det tyske acetaldehyd, og det kinesiske navn er lettere at forstå, fordi alanin indeholder tre carbonatomer og dets kemiske navn er alanin.Dette er et simpelt navn, ligesom aminosyrens karakter.Alanins sidekæde har kun én methylgruppe og er lidt større end glycins.Da jeg tegnede strukturformlerne for de andre 18 aminosyrer, tilføjede jeg grupper til alanin.I proteiner er alanin som en mursten, et almindeligt grundlæggende byggemateriale, der ikke er i konflikt med nogen.
Sidekæden af alanin har ringe hindring og er placeret i α-helixen, som er en konformation.Den er også meget stabil, når den er β-foldet.I protein engineering, hvis du ønsker at mutere en aminosyre uden et specifikt mål på et protein, kan du generelt mutere det til alanin, hvilket ikke er let at ødelægge den overordnede konformation af proteinet.
Indlægstid: 29. maj 2023